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客戶只需把小鼠腦寄來,我們會進行一系列透明化處理,并在我們的成像設備上進行掃描成像,得到所有腦片的最大值投影圖,再通過我們的高性能計算集群,以及自研的算法和軟件,實現對圖像大數據的存儲、管理和多種分析,包括三維重構、圖譜配準和神經元形態重建等。客戶只需等待十天左右既能夠得到滿意的結果。在整個試驗過程中客戶都能在我們的網站上看到實驗的實施進展。
PuClear透明化技術特點:
1. 共價固定結構: PuClear透明化技術采用共價鍵固定結構的方式,將腦片內的蛋白質、核酸等結構與水凝膠框架結合在一起。
2. 原位結構保留: PuClear技術在透明化處理過程中,腦片內的結構保持在原位,不會發生移動或失真。
3. 光學性能改善: PuClear透明化處理后,光線通過組織時不會發生偏折,可以實現清晰、均勻的三維成像。相比之下,傳統的透明化處理方法可能會導致光線的散射或折射,影響成像質量。
4. 成像范圍擴大: PuClear技術可以處理較厚的組織樣本(如腦片),使得成像范圍擴大到了300μm厚度范圍內。傳統的透明化處理方法可能對較厚的組織樣本效果不佳,成像范圍受到限制。
多維同步飛掃熒光顯微成像(VISoR)技術是一項新型快速三維微米分辨成像技術。它結合了腦組織透明化、同步掃描成像和三維重構技術,能夠以很高的分辨率在短時間內完成小鼠全腦突觸級別的解析。該技術的主要特點包括:
1. 同步掃描實現連續清晰成像: 通過同步掃描,實現了在樣品運動中連續清晰成像,大大提高了成像速度,達到了數百倍于傳統成像技術的速度。
2. 快速成像速度: 在1.5小時內即可完成對小鼠全腦的成像,每個體素的分辨率為0.5×0.5×2.5 μm3,生成的原始數據圖像約為16TB。
3. 多通道成像: 適用于不同大小的樣品,可以進行多通道成像,包括小鼠腦等組織樣品,具有廣泛的應用前景。
4. 兼容各種標記方法,可擴展至超大樣品: 該技術兼容各種標記方法,可用于不同類型的樣品,甚至可以擴展至超大樣品的成像。
我們通過搭建的高性能計算集群,以及自主開發的算法和軟件,實現了對PB級圖像大數據的存儲、管理和多種分析,包括圖像拼接、三維重構、圖譜配準和神經元形態重建等。
而PB級圖像大數據分析(Petabyte-scale image data analysis)具有以下特點:
1. 處理規模龐大: PB級圖像大數據意味著數據量非常龐大,需要處理的圖像數量可達到百萬級甚至更多。這種大規模數據需要使用高效的計算和存儲系統來進行處理和管理。
2. 高維度數據: 圖像數據通常是高維度的,每個像素可能包含多個維度的信息,因此,對于PB級圖像大數據的分析需要考慮到數據的多維特性。
3. 計算密集型: 對PB級圖像大數據進行分析通常需要進行大量的計算,例如圖像處理、特征提取、模式識別等。這些計算通常是密集型的,并且需要使用高性能的計算資源來進行處理。
4. 存儲需求高: PB級圖像大數據需要大規模的存儲系統來進行管理和存儲。這些存儲系統需要具有高容量、高可靠性和高吞吐量的特點,以滿足數據存儲和訪問的需求。
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